原文
数量:16 (4)DOI: 10.21767 / 0972 - 768 x.1000289前所未有的例子与1-Aminomethyl-1-Cyclohexane乙酸金属配合物
- *通信:
- Amshumali可大学化学系,Vijayanagara斯克利须那德瓦拉亚的统治,智Sagara校园,宿营地,Vinayakanagar, Bellary,卡纳塔克邦,印度,电话:+ 91 - 9481968706;电子邮件: (电子邮件保护)
收到:2018年10月15日;接受:2018年10月26日;发表:2018年10月30日
引用:Amshumali可,身为理发师N,帕蒂尔m .前所未有的例子与1-Aminomethyl-1-Cyclohexane乙酸金属配合物。Int J化学科学。2018;16 (4):289
文摘
一个新的协调钴和镍的配合物合成使用加巴喷丁,[1 -(氨基甲基)1-cyclohexane醋酸]作为配体。配合物已经XRD的特征。单晶x射线衍射研究表明,钴复杂(1)协调和加巴喷丁四个分子和镍复杂(2)与加巴喷丁。此外,配体在中性形式复杂的(1)和(2)两性离子形式复杂。复杂的分子对接研究(1)显示,这个复杂的可能比加巴喷丁有更好的活动。
关键字
加巴喷丁;分子对接;Metal-gabapentin复杂
介绍
(1)-氨基甲基1-cyclohexane醋酸俗称加巴喷丁是一个安定药药物通常是规定结合其他药物预防癫痫发作疾病和治疗某些情绪障碍,焦虑和迟发性运动障碍1]。最近加巴喷丁已经先进的治疗神经性的疼痛(2]然而,加巴喷丁的作用机制仍然是一个相当大的话题讨论(3)很多报纸最近发表在gabapentin-containing构象的研究肽(4),在立体化学5)和环合反应涉及加巴喷丁(6- - - - - -10)和过渡金属催化剂(俄文、操作系统和红外)。但是,没有协调化合物生物活性金属配合物的加巴喷丁已报告除了一个最近的沟通报告的布拉加出版社(11在锌和铜复合物的机械化学的准备加巴喷丁的报道。自知识如何加巴喷丁分子与金属离子在生物系统结合是重要的理解加巴喷丁的作用机制,我们开始加巴喷丁的离体的合成和研究金属配合物。在本文中,我们报告的有效和简单的解决方案阶段加巴喷丁的合成和结构表征金属钴和镍的配合物,对协调。gabapentin-cobalt复杂的分子对接研究也是本文中描述。加巴喷丁的钴和镍配合物,可以很容易地实现在实验室通过加热金属盐的化学计量量与加巴喷丁(钴或镍),在水里。集中和冷却了沉淀产生的复杂的1和2。
实验
合成cobal[加巴喷丁]4;{有限公司(H2O)2(加巴喷丁)4}
0.8克(4.66更易)的加巴喷丁和0.34克(1.167更易)在100毫升硝酸钴被烧杯和50毫升的水是补充道,加热混合物和体积减少到20毫升,在冰箱里冷却。3天后好红色晶体开始形成。晶体被过滤分离。收益率:65%。元素分析:钙。C: 46.03, H: 4.26, N: 7.96%。H C: 46.11: 4.22, N: 8.01%。
{镍的合成(H2O)5(加巴喷丁)所以4}
0.6克你4.6H2更易与O(2.326)和0.8克加巴喷丁在100毫升(2.326更易)被烧杯和50毫升的水是补充道,加热混合物和体积减少到20毫升,在冰箱里冷却。3天后好绿色晶体开始形成。晶体被过滤分离。收益率:60%。元素分析:钙。C: 29.95, H: 6.49,年代:7.78 N: 3.36%发现:C: 29.87, H: 6.49, 7.84, N: 3.38%。
结果与讨论
1和2的晶体结构
单晶的形成1和2是通过溶解水的最低额度的复杂和缓慢的蒸发在实验室条件。一个合适大小的晶体安装使用Mitigen micromount,和单晶数据收集是一个力量聪明x2桌上型衍射仪配备了micro focus MoKα辐射(λ= 0.71073)在室温下(8]。这台机器是在50 kV和1马。使用SAINTPLUS数据减少了。使用SADABS缩放、吸收校正完成,先端2中的所有嵌入式软件套件(8]。晶体结构是通过直接的方法解决了使用XS和结构优化使用XLin SHELXTL包(9]。的位置和热参数non-hydrogen原子都是精致的。氢在几何计算固定位置和精制各向同性的。创建ORTEP图和包装图使用汞3.0和观点射线。水晶和实验数据为化合物1和2中列出表1和2分别。粉数据收集与对位分析x 'pert pro配备'Celerator探测器。用铜阳极x射线源在40 kV和40 mA。计划粉细胞- 2.2 x射线粉末用于计算模式。
| 化合物的识别 | 红色的水晶 |
|---|---|
| 化学公式 | CoC27H30.N4O10 |
| 配方奶粉的质量 | 703.80 |
| 晶系 | 三斜晶系的 |
| 空间群 | p - 1 |
| 一个(一) | 12.5889 (6) |
| b (A) | 12.6216 (5) |
| c(一) | 14.3626 (7) |
| β(A) | 100.466 (4) |
| 细胞体积(单位3) | 2197.02 |
| Z | 15 |
| 温度(K) | 296 (2) |
| ρ钙(g厘米3) | 1.172 |
| F (000) | 1840年 |
| 水晶大小(毫米3) | 0.30×0.27×0.19 |
| 不。的反射测量 | 4229年 |
| 不。独立的思考 | 2717年 |
| 无线电侦察 | 0.0571 |
| _ρ最小、最大(e3) | -0.32,0.24 |
| 最后R1值(> 2σ(我)) | 0.054 |
| 最后或者说是(F2)值(> 2σ(我)) | 0.143 |
| 最后R1值(所有数据) | 0.098 |
| 最后或者说是(F2)值(所有数据) | 0.167 |
| 拟合优度(混) | 1.012 |
表1:结构信息复杂的1。
| 化合物的识别 | 绿水晶 |
|---|---|
| 化学公式 | C9H27太阳亮度11倪 |
| 配方奶粉的质量 | 416.09 |
| 晶系 | 三斜晶系的 |
| 空间群 | p - 1 |
| 一个(一) | 6.0146 (4) |
| b (A) | 8.5196 (4) |
| c(一) | 35.0416 (19) |
| β(A) | 93.688 (4) |
| 细胞体积(单位3) | 1791年 |
| Z | 0 |
| 温度(K) | 296 (2) |
| ρ钙(g厘米3) | 1.693 |
| F (000) | 1840年 |
| 水晶大小(毫米3) | 0.30×0.24×0.19 |
| 不。的反射测量 | 2717年 |
| 不。独立的思考 | 2717年 |
| 无线电侦察 | 0.0622 |
| _ρ最小、最大(e3) | -0.32,0.24 |
| 最后R1值(> 2σ(我)) | 0.0711 |
| 最后或者说是(F2)值(> 2σ(我)) | 0.143 |
| 最后R1值(所有数据) | 0.096 |
| 最后或者说是(F2)值(所有数据) | 0.161 |
| 拟合优度(混) | 1.078 |
表2:复杂的2的结构信息。
x射线结构决心让我们明确识别complex1的形成。(图1)。钴的八面体的协调和两个水分子和加巴喷丁四个分子。加巴喷丁协调通过氧羧酸盐与Co-O键长2.064(2)°和2.088(2)°所有债券的长度在预期范围内(图2)。给出了详细的结构信息表1。在复杂的2,(图3 - 7),加巴喷丁在两性离子形式和corboxylate氧气结合键长倪.....镍O是大约2.036°。给出了详细的结构信息表2。
图1:的分子结构有限公司(H2O)2(加巴喷丁)4]。
图2:粉末XRD的复杂模式1。
图3:的分子结构(Ni (H2O)5(加巴喷丁)]4。
图4:粉末XRD的复杂模式2。
图5:目标受体压敏电阻器钙通道亚基α2 / delta 1(绿色彩带)停靠Cobalt-tetragabapentin(彩色线框)。
图6:目标受体压敏电阻器钙通道亚基α2 / delta 1(灰颜色的分子表面)停靠Cobalt-tetragabapentin(彩色线框)。
图7:目标受体压敏电阻器钙通道亚基α2 / delta 1(灰颜色的分子表面)停靠与加巴喷丁(蓝颜色的线框)。
复杂的分子对接1
在silco研究:Chem-Sketch ACDLABS 10.00软件被用来设计配体Cobalt-tetra-gabapentin和加巴喷丁3 d优化紧随其后。这些配体的Sybyl Mol2格式的文件转换成蛋白质数据库(pdb)格式使用开放软件(巴别塔10]。加巴喷丁的目标受体压敏电阻器钙通道亚基α2 / delta 1及其氨基酸序列从Drugbank[引起11]。一个3 d模型目标蛋白质的氨基酸序列是由ESyPred3D web服务器(12)使用3 d结构PDB Id: 3 lia链' A '作为模板。Gastieger原子电荷、溶剂删除文件和氢被添加到受体受体的制备对接仿真Autodock 4.2 (13]。对接分析使用Autodock 4.2 [13- - - - - -17]。扭转在配体被设置为6和非极性氢受体中合并。AutoGrid 4.2程序,提供AutoDock 4.2是用来制造网格地图。网格框大小设定在62年,62年和62°(x, y, z)包括所有在场的氨基酸残基的大分子的活性部位。拉马克学说的遗传算法(LGA)被选为搜索最佳矫形器与最低的结合能。结果分析研究交互,绑定能源和氢键相互作用最好的矫形器和中给出表3。
| 参数 | 加巴喷丁 | Cobalt-tetragabapentin |
|---|---|---|
| 绑定能源 | -5.5 | -7.64 |
| 配体的效率 | -0.46 | -0.15 |
| 抑制常数 | 92.71�米 | 2.5�米 |
| 分子间能源 | -7.29 | -15.1 |
| 静电能量 | -2.72 | -5.69 |
| Vdw_hb_desolvation能源 | -4.57 | -9.4 |
| 全内能源 | 0.05 | 0.31 |
| 扭转能源 | 1.79 | 7.46 |
| 未绑定能源 | 0.05 | 0.31 |
| H-bonds | 03 | 03 |
表3:比较分子对接结果加巴喷丁和Cobalt-tetragabapentin来自Autodock 4.2。
这个结果清楚地表明,复杂的5月1日在加巴喷丁有更好的效率。
结论
我们首次研究了加巴喷丁复合物含有钴和镍金属离子。分子对接研究显示了复合物比单独加巴喷丁更活跃。此外,体内复合物的研究证明了有效性和安全性作为药物正在进行。
确认
作者感谢教授专家一行,SSCU、印度,班加罗尔提供VSK大学的仪器设备和研究设施。
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