原文
数量:22 (3)DOI: 10.37532 / 0974 - 7419.2022.22 (3) .183蛋白质组学及其类型
收到:2022年3月6日,手稿。tsac - 22 - 76390;编辑分配:2022年3月8日,PreQC不。tsac - 22 - 76390 (PQ);综述:2022年3月21日,质检不。tsac - 22 - 76390 (Q);修改后:2022年3月22日,手稿。tsac - 22 - 76390 (R);发表日期:2022年3月24日。DOI: 10.37532 / 0974 - 7419.2022.22 (3) .183
引用:马丁·R。蛋白质组学和他们的类型。肛门化学印第安纳j . 2022; 22 (3): 183。
文摘
这个词蛋白质组学指的是所有蛋白质的综合考试在一个特定的示例和被定义为基因的蛋白质补充。大量的使用方法,和许多关于蛋白质回答查询。后面的材料集中在计算蛋白质识别的元素。还有一个量化的简短讨论,样品比较和描述
关键字
蛋白质组学;蛋白质
介绍
改变数量的一些蛋白质。大多数low-abundance蛋白质以来的大部分目前设备用于检测蛋白质生物样品不能处理的复杂性。创建一个适合小样本集的深入研究,可以单独的蛋白质存在于原样品使用不同的技巧。三个主要部分构成一个质谱仪:离子源,分裂细胞,质量分析器。因为每个元素函数几乎独立于他人,可以结合各种技术特性创建多种类型的质谱仪。一个分子必须电离计算它的分子质量。这发生在质谱仪的离子源。源可以是Matrix-Aided激光解吸电离(MALDI),这是适合样品混合矩阵并固定在一个金属板,或电喷雾电离(ESI),适用于液体样品。
两种类型的质量分析器,在蛋白质组学实验室最常用的离子阱(IT),陷阱的无线电频率的改变,驱逐离子被检测到,和飞行时间(TOF)分析所需的时间离子通过一个电动舞台,“飞”地区的仪器定时和相关离子的质量。大多数现代乐器有一个分裂细胞的破坏肽通过Collision-Induced离解(CID)使用一种惰性气体。然而,碎片会发生“自发”或不存在的分裂细胞(将和postsource衰变)。所有质谱仪测量质荷比,而不是质量本身。结果,测量了取决于分子的电荷状态或状态。
当使用二维凝胶电泳分离蛋白质,本质上创建几个景点,每一个都包含一个占主导地位的蛋白质。可以保持酶的消化,蛋白质和肽质量可以由女士从历史上看,基质辅助激光解吸电离飞行时间(MALDI-TOF)装置被用来量化消化蛋白质的质量。因为大多数MALDI-TOF-MS产生的离子单独起诉,这是简单的确定肽的质量。后信号处理所得到的质谱肽实验质量产生的列表。实验谱也指这种大规模列表。每个蛋白质序列和实验肽质量列表可以比作对蛋白质数据库搜索的数据。cConceptually,及简单介绍了数据识别通过数据库搜索看似女士的想法。然而,假身份的危险增加时扫描大数据集或访问的数量肽也受到了限制。的特异性及数据进一步减少修改的存在(盐)或部分裂解肽。此外,实验设置可能不会适用于二维凝胶分析,在这种情况下,假设一个蛋白质研究不再是事实。因此,MS技术,允许许多蛋白质的研究和提供额外的数据在每个肽将是一个重大的进步及以上。有许多方法来触发肽分裂过程,用惰性气体等的影响。外面是本研究的范围提供一个全面的解释肽分裂过程。然而,简而言之,当一个肽分解,两个分子(前缀和后缀)。许多(尽管不是所有)的前缀和后缀离子因为肽的各种副本可以分散。另一方面,完整的肽不能分散。
复杂的多肽混合物的调查是通过识别个人的能力肽因为肽可以通过信用证容易分离。通过这种方法,它不再是所有蛋白质的需要肽包含在一个单一的谱,与及一样。常见的做法是使用一个LC-ESI-MS / MS仪器视模式检查液体样品。换句话说,包含的液相肽不断交付和电离质谱仪的来源而肽由一个LC列。一些氨基酸可能接受天车或其他化学变化,导致大规模的转变。准确地构造理论MS / MS谱,必须考虑这种质量的变化
可靠的蛋白质识别的第一步是获取可靠的肽识别,但仍有其他因素必须考虑。肽共享的大量蛋白质蛋白质识别问题的主要原因。最常见的方法是简单地添加最高分数为每个不同的肽。或者,您可能使用的各种光谱与每个肽作为额外的证据。两种不同的检测肽在一个可接受的肽得分是一种传统的接受一种蛋白质识别要求。这种方法会产生一个非常最少的错误识别。
