文摘

发展MICROBASE连接大型微生物和环境数据集

作者(年代):Patel PN, Trivedi英航贾尼HJ Ratna Trivedi

新分析技术微生物学已创造了许多潜力调查微生物群落,他们相互作用,及其作用生态系统在小说方面的功能。这些技术的组合允许大型数据集的快速生成describingmicrobial群落组成和跨时间和空间的变化。为了解决生态相关问题,微生物群落datasetsmust与相关环境数据集。这个富有挑战性的任务是可行的数据挖掘通过一个复杂的数据环境模型和互动与关系数据库查询工具。论述了动机和设计一个这样的微生物生态数据库,研究问题进行处理的信息项目。设计原则和数据模型的数据库开发期间使用。架构,支持进步进化的信息系统也进行了讨论。在数据交互的用户社区模型发展是至关重要的。这个应用程序是customdesigned链接的需求和目标微生物和环境问题,强调贡献frominformatics生态。的履历表模型反映了数据挖掘政权的微生物学科研究和支持是不可能问的问题没有这样的信息工具。该项目还作为典型案例研究数据模型与信息系统的设计,不仅对microbialenvironmental数据集,但在一个更广泛的角度来看,对其他生物数据库可以适应这里使用的技术数据集成和采矿。