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蛋白酶
蛋白酶(也称为肽酶或蛋白酶)是一种催化(增加速率)蛋白质水解的酶，蛋白质分解成更小的多肽或非氨基酸。它们通过水解的方式来切断蛋白质内部的肽键，这是一种水破坏键的反应。蛋白酶在许多生物功能方面都令人担忧，包括消化摄入的蛋白质、蛋白质分解代谢(旧蛋白质的分解)和移动信号。如果没有额外的支持机制，蛋白质水解将非常缓慢，需要许多年的时间。蛋白酶可以在各种生命和病毒中发现。它们已经独立地进化出了几个实例，特定种类的蛋白酶可以通过完全不同的催化机制进行相同的反应。1993年，根据蛋白酶的进化趋势，首次将蛋白酶分为84个科，并分为丝氨酸蛋白酶、半胱氨酸蛋白酶、天冬氨酸蛋白酶和金属蛋白酶四种催化蛋白酶。苏氨酸蛋白酶和谷氨酸蛋白酶分别在1995年和2004年才被发现。用于切割肽键的机制包括使具有半胱氨酸和苏氨酸(蛋白酶)或水分子(天冬氨酸，金属和酸性蛋白酶)的氨基酸残基亲核，以便能够攻击肽羧基。制造亲核试剂的一种方法是通过催化三联体，其中组氨酸残基被用来促使丝氨酸、半胱氨酸或苏氨酸成为亲核试剂。
