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膜厚度和带电Protein-Lipid交互

阿勒娜约翰逊^*

*通信:

阿勒娜约翰逊
科学编辑,医学杂志,乌克兰
电子邮件:editor.elena19@gmail.com

文摘

带电氨基酸已知影响积分和外周膜蛋白的功能,以及细胞破坏肽。尽管原子的分子动力学研究了力学的膜蛋白质组绑定和易位,全方位的影响膜的理化特性和拓扑结构还有待解决。在这个研究中,我们研究了一个精氨酸(Arg)侧链模拟穿过饱和磷脂酰胆碱(PC)影响烃尾巴长度从10到18个碳。免费的能源资料都表现出大幅攀升为核心渗透到碳氢化合物的增加,与可预见的变化之间的各种厚度的影响,最终减少障碍从26个千卡每摩尔18个碳为10个碳6千卡每摩尔。

介绍

生物膜包含一系列蛋白质起着至关重要的作用,以及保护壳,有效地防止极性和带电分子渗透不涉。这个概念,基于能量的离子通过油膜板移位,影响了几十年。根据最新的研究,细胞膜并不是像之前想象得那么不透水。因为带电蛋白质精氨酸(Arg)和赖氨酸等组织(赖氨酸)会影响蛋白质结构和功能,以及一系列cell-perturbing肽的影响,至关重要的是要了解如何收取与蛋白质组生物膜在分子水平上。[1]

影响生产非极性脂质分子的片状区域通常描述为生物膜。由于刚性板模型的大障碍,带电分子(的数十千卡每摩尔)必须经过膜界面时脱水。这个假设最近受到所谓“明模式”的电压门控离子通道激活,预测lipidexposed运动几个带电Arg残留在脂质膜。[2]细胞生物学测试使用膜蛋白质合成的易位子机械表示低能源插入Arg的成本在一个跨膜蛋白部分,对理论提出了质疑。的成本只有4千卡每摩尔,将Arg host-barrel蛋白质(OmpLA)上的12-carbon Dilauroyl-PC (DLPC)膜最近被提出。这种明显的差异理论和实验引发了一场激烈的争论如何解释这些结果,导致一系列新的研究脂质膜的机电行为。缺乏的分子水平上的描述膜电荷传输机制,连续体的基本理念是,膜保持稳定了近半个世纪。所有原子分子动力学(MD)的实验中,另一方面,揭示了一些意想不到的(尽管在40年前Parsegian)预测的物理化学行为与脂质双分子层可变形性。带电分子现在画的存在水和脂质组负责人对非极性膜核心。由此产生的自由能源概要文件(或潜在的意思是力量,及收取易位完全不同于早期的连续介质模型,因为分子没有完全脱水但必须付出代价的变形的膜。缺乏敏感性的易位能量的化学特性带电分子或蛋白质组(Vorobyov et al .,在准备),绑定抗衡离子的阴离子脂质组负责人,甚至膜的偶极子潜力都严重影响这个意想不到的结果。[3]

结论

MguanH +的易位,侧链模拟一个参数,在脂质与不同的疏水膜厚度使用原子论的模拟研究。根据我们的观察,MguanH +生成等于各影响水分子通过膜变形,脂质组负责人到碳氢化合物的核心。H-bonding,溶剂化作用和交互能量MguanH +的膜非常相同,除了转变由双层疏水厚度的差异造成的。当数据绘制距离的函数接口而不是双层中心,变形和离子微环境在所有影响非常相似。