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,卷:15(6)

蛋白质配体结合机制中卤素的结构视角

*通信:
瑞尼Yuong英国贸易科学公司编辑部LD乐动体育官网电子邮件: (电子邮件保护)

收到:2021年6月3日;接受:2021年6月14日;发表:2021年6月25日

引用:杨文荣。蛋白质配体结合机制中卤素的结构研究。机械工程学报,2017;15(5):23。

摘要

许多理性药物化学应用在药物设计中,主要关注卤素原子。氟原子和氯原子经常用于改善物理化学性质,溴和碘原子通常用于提高选择性。量子力学和统计分析已被用于研究有利的卤素相互作用,如卤素键。虽然大多数研究集中在卤素通过其-孔的相互作用,但氢键也起着重要作用。我们研究了卤素原子在蛋白质配体中的相互作用环境。由于PDB中的结构冗余,对特定分子相互作用的倾向进行了修改,并进一步研究了使用卤素进行合理药物设计的意义。

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许多理性药物化学应用在药物设计中,主要关注卤素原子。氟原子和氯原子经常用于改善物理化学性质,溴和碘原子通常用于提高选择性。量子力学和统计分析已被用于研究有利的卤素相互作用,如卤素键。虽然大多数研究集中在卤素通过其孔的相互作用,但氢键也起着重要作用。我们研究了卤素原子在蛋白质配体中的相互作用环境。由于PDB中的结构冗余,对特定分子相互作用的倾向进行了修改,并进一步研究了使用卤素进行合理药物设计的意义。最后,我们强调了卤素键的罕见发生,并讨论了卤素在蛋白质配体复合物中的附加功能,使药物化学指南对合理的卤素相互作用进行了总结。近年来,关于蛋白质数据库1 (PDB)结构的公开可用结构数据的数量急剧增加,在短短十年内从47000个增加到134000个。例如,计算机辅助药物设计得益于这种丰富的结构数据,提高了我们对小分子结合的理解。因此,各种方法的可视化,分析,比较蛋白质配体相互作用已经开发。 Numerous studies have detailed specific interactions, such as hydrogen bonds and sulfuroxygen interactions, over the years. Fluorine (F), Chlorine (Cl), Bromine (Br), and iodine has all been incorporated into designed药物不同的原因:通过添加溴或碘来提高选择性,通过添加氯和氟来提高ADME性能,或者减少不必要的反应,如环羟基化。虽然研究了它们在药物化学中的许多活动,但也研究了它们创建分子接触的能力,以便更好地了解它们在提高结合亲和力方面的作用。LD乐动体育官网在它们的赤道侧,重卤素元素,如氯、溴和碘具有各向异性的电子分布,导致沿着它们的共价键有一个正的外部区域,称为σ空穴。其大小由多种情况决定,包括存在较重的卤素或电子吸收支架,从而导致较大的正σ空穴。氟在不常见的情况下有这样一个区域,但由于它的强电负性,一般认为它缺乏σ-hole。涉及卤素的分子相互作用主要研究在σ-区。第一个非共价卤素相互作用是在20世纪50年代描述的,术语“卤素键”是在20世纪90年代末创造的。多种亲核试剂,如氧、sp3杂化氮、芳香环或硫,都是卤素键的受体。

谷歌学者引证报告
引文:521

有机化学:一份印度期刊收到521次引用,根据谷歌学者报告

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