摘要

基于DNA拓扑异构酶1的脑癌硅化药物设计

作者(年代):Sasikumar P, Pandieswari S, Samundeeswari S, Vanitha M

药物设计是根据药物的生物靶点设计药物的方法。通常，药物靶点是参与特定的代谢或信号通路的关键分子，这些代谢或信号通路针对疾病状况或病理，或针对微生物病原体的传染性或存活。药物分子的结构可以与生物分子特异性相互作用，可以使用计算工具进行建模。这些工具可以利用药物分子的结构和活性位点的性质，在生物分子内构建药物分子。药物分子的构造可以由内而外，也可以由外而外，这取决于是先选择核心基团还是先选择r基团。然而，这些方法中的许多都受到合成实际问题的困扰。药物设计中使用的计算工具之一是ÂÃ， Â " chemsketchÂÃ， Â "，准确率为65%。从药物数据库下载药物结构，通过在药物官能团上引入醇、甲基、氢氧化钠等对结构进行修饰。获得的新药物经过各种分子建模和动力学来降低其能量水平。对接使用几何优化的分子作为配体，蛋白质DNA拓扑异构酶I作为蛋白质，使用SPDB查看器将其化学图形式转换为PDB格式。 HEX software is used for this purpose.