文摘

数据集成:氨基酸基因坐标

作者(年代):Priyanshu沙玛

我们理解genotype-phenotype连接与蛋白质组学的结合,将增加转录组,基因变异注释数据。这种multi-omic调查并没有扩展到chemoproteomics,评估方法固有的反应和可能的“druggability”亲核氨基酸侧链,部分原因在于挑战参与适当inter-database映射。我们测试了映射方法来连接半胱氨酸和赖氨酸残基被chemoproteomics基因组的位置。数据库更新周期和依赖稳定的标识符,根据我们的调查结果,可能导致广泛的标记残留的误认。我们结合chemoproteomics数据与计算方法预测基因变异的致病性,发现密码子的高活性半胱氨酸对遗传变异丰富预测更有害,允许我们识别和功能描述一个新的半胱氨酸蛋白酶caspase-8有害残留。