摘要

抗菌肽词典:精氨酸和色氨酸序列的综合列表

作者(年代):柯林斯淡褐色

阳离子抗菌肽(amp)的活性一直局限于经过充分研究的自然序列或从无开始合成的小组肽。我们已经详细研究了导致amp活性形成的潜在主要结构元素。我们研究了所有潜在肽的完整集合，最多7个残基长，由带正电荷的精氨酸(R)和/或疏水色氨酸(W)组成，这两种最普遍的性质与活性有关。最短的活性肽长度为4或5个残基，对革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的活性总体情况相似。我们发现这三种生物都有一个单一的活动峰值，对应的序列R约为40%;连续的W二联体和三联体的存在也增加了活动。这些活性背后的机制包括脂质结合，特别是与带负电荷的膜结合，以及肽聚集，这是一种以前未知的肽的作用方法。当考虑每个肽残基的活性时，最大的特异性抗菌活性似乎出现在大约有10个残基的肽中，这意味着产生较大肽的“收益递减”。