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摘要

一种预测某些多肽电泳迁移率的简单方法

作者(年代):Rahmatollah Rajabzadeh, Maziar Ahmadi Golsefidi, Gozal Inchebroni

本研究以分子结构描述子为基础,利用偏最小二乘分析,得到了一些多肽迁移率较好的定量预测关系。对每种肽生成了5类分子描述符,包括拓扑描述符、几何描述符、官能团描述符、经验描述符和性质描述符。将常数和近常数变量排除在描述符之外,然后将对相关性为0.95的描述符排除在外,剩余的描述符总数为72个,我们使用这些描述符进行遗传算法(GA)变量选择。随机选取12个多肽序列,检验所建立模型的预测能力。所选模型的RMSEP为0.492。


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