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预测模型研究构效关系的抗菌肽

作者(年代):Quhuan李

Gene-encoded抗菌肽(安培)广泛分布于各个阶层的生活从植物到动物,包括两栖类、鸟类、鱼类、哺乳动物等。以前的特点,迅速和特异性,和活动对一些细菌,真菌、病毒、原生动物和癌细胞,让众多的发展抗菌肽作为治疗药物可能有用的属性。开发活动的预测工具基于理解的结构活性关系的作用是不可避免的药物设计。手动在这项研究中,我们收集了1162抗菌序列首先,然后建造一个综合设计平台研究构效关系的抗菌肽,最终构建了一个新的活动和逐步判别分析预测模型。这个模型集成七理化参数,包括长度、分子量、理论π,主要氨基酸组成不稳定指数、脂肪指数和大平均hydropathicity电荷。预测模型的分类正确数据库中的已知活性肽的70%,并预测77.8%的新的未知的活性肽。结果表明,该模型可以识别和分类判别函数组成的四个活动有效抗菌肽。


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